客户焦点：Rune Labs如何利用InfluxDB收集的传感器数据改善帕金森症患者的生命质量
作者：Caitlin Croft / 产品，用例
2022年12月20日
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Caitlin: 请告诉我们一些关于您自己和Rune Labs的信息。
Carolyn: 我在大学时学习了神经科学——在那里我进行了计算研究，并在学术环境中学习编写代码。大学毕业后，我在生物和神经科学领域工作，然后作为软件工程师加入了几家初创公司。2019年，我在寻找新工作的时候发现了Rune Labs。当时，它是一家小型公司，是我两个热情的完美结合：神经科学和软件工程。
Rune Labs是一家专注于精准神经学的软件和数据分析公司，支持护理交付和治疗开发。我们从各种来源收集和处理数据，包括移动应用、植入患者体内的传感器以及患者的可穿戴设备。我们主要在帕金森症医学研究和治疗领域工作。我们很幸运很早就建立了这些合作伙伴关系；由于治疗帕金森症症状和副作用的大脑深部刺激（DBS）设备，有很大的潜力。我们的StrivePD平台是帕金森病的护理交付生态系统，使患者和临床医生能够通过提供汇总各种患者数据源的定制仪表板，以及将患者连接到临床试验，更好地管理帕金森病。
大脑深部刺激技术并不新鲜，但最近有很多发展；较新的技术能够刺激大脑并记录神经活动。你可以把它们想象成植入大脑的电极。随着记录能力的进步，有很多学术研究和临床潜力。
Caitlin: 您在Rune Labs已经工作了三年多——自加入以来您的职业生涯如何发展？
Carolyn: 大约一年前，我转到了工程管理岗位；虽然我不再像以前那样深入技术细节，但Rune Labs的工程经理仍然是相当技术的。我这些天写的代码少了，但我忙于战略技术规划、工程和架构设计。
我目前管理的团队专注于我们的ETL数据摄取管道——从数据上传到数据处理的各个阶段，以及查询API。大量进入的数据是数值时间序列数据，这就是我们转向InfluxDB的原因。我们称之为数值时间序列数据，因为数据包含时间戳和至少一个数值（可能有多个数值）。一旦数据从原始数据中清洗和提取出来，它就在我们的平台上使用并存储在InfluxDB中。我的团队负责暴露数据的查询API。
Caitlin：Runelabs如何帮助帕金森病患者？
Carolyn：我们的平台收集实时数据，帮助患者更好地理解帕金森病患者的日常生活。数据来自DBS设备、我们的iOS应用以及Apple Watch集成。Runelabs与设备制造商合作开发软件，帮助他们更好地利用数据。我们有一个临床医生门户网站，他们可以在那里查看患者请求我们与他们分享的数据。
Runelabs的目标包括
- 改善患者治疗方案 - 展示有助于提高数据驱动医疗保健决策的患者数据。
- 更好地理解患者的症状 - 帕金森病具有广泛而复杂的症状，难以跟踪。
- 使用真实患者数据实现数据驱动 - 减少跟踪患者状况的负担，简化跟踪环境和生活方式（例如睡眠和饮食）选择如何影响他们状态的过程。
- 简化医疗服务 - 创建有用的数据可视化，使医生预约更顺畅、更有效。
DBS设备需要重大脑部手术，并非所有帕金森病患者都选择或符合手术条件。这些设备在治疗帕金森病的症状方面非常有效：它们不能治愈帕金森病，但可以大大改善患者的生活质量。一旦植入，需要时间调整设置以确保患者获得最大益处。需要一支专家团队花费时间调整每个患者的最佳设置；在患者和临床团队之间有大量的交流和协商。
深部脑刺激器是直接植入患者大脑的电极。它们与起搏器有些相似。起搏器是闭环系统，大多数起搏器通过检测电活动来刺激心脏。然而，批准的DBS设备不是闭环系统；它们要么开启，要么关闭。您可以调整设置，但它们（目前）不能检测大脑中的活动并相应地刺激大脑。使它们具有适应性是当前研究的前沿。
Runelabs帮助推动研究方面的工作，使开发使DBS设备成为闭环系统所需的算法更容易。数据目前存储在DBS设备中，直到患者到达医生办公室；在那里，使用特殊平板电脑从设备中提取指标。设备的一个优点是，患者可以向医生分享的不仅仅是他们在临床办公室的状态，还可以是患者记录的纵向状态快照。
Caitlin：请告诉我们Runelabs的InfluxDB实施情况。
Carolyn：我们需要一个可以收集时间戳数据并查询的工具。我们已经使用InfluxDB OSS一段时间了，在考虑了其他工具后，我们最终选择了InfluxDB Cloud。我们知道，在准备分析更多患者数据时，我们需要升级到InfluxDB Cloud。我们正在使用InfluxDB为用户提供来自DBS和可穿戴设备收集的传感器数据可见性。
我们使用InfluxDB存储所有生产数据。我们从各种设备收集数值时间序列数据，包括深部脑刺激设备的电生理活动。我们将这些原始数据进行清洗、标准化，并存储在InfluxDB中。我们使用Go客户端库进行读写操作。从Go应用程序直接写入后，数据被用于用户看到的仪表板和可视化。我们希望根据我们了解的，为临床医生提供预构建的、最有用的可视化。我们不希望让他们接触或学习查询语言。最终，我们的数据被发送到AWS进行云存储。
内部，我们使用InfluxDB的UI和笔记本来开发新查询。我们查看原始值，因为这对开发最有用。通常，我们在UI中查看输出表，确保它们看起来正确。
Rune Labs非常重视安全和隐私。这反映在我们存储InfluxDB中的数据的方式上。我们的数据模式非常简单：时间序列用唯一的不透明ID标记，该ID不直接与患者的身份相关联。在我们的平台中的另一个单独的数据库中，我们存储将患者与他们的时间序列数据链接的元数据。这使我们能够控制整个架构中的信息流：我们能够确定平台中哪些位置有敏感信息，因此我们可以在访问该架构部分时特别小心，并遵守隐私最佳实践。
在时间序列项目中，随着时间的推移，数据粒度变得不太重要。然而，我们的内部神经科学研究团队希望拥有丰富的历史数据集，尽可能多地具有粒度。他们经常希望获取所有原始数据度量；他们不希望得到时间平均。因此，延迟是我们的一项持续重要项目，我们需要确保临床医生能够访问门户和图表。
“我们喜欢依赖InfluxDB Cloud，因为它具有水平扩展性。它是自托管的，我们不必担心不断增长的数据集。”
Carolyn Ranti - Rune Labs 工程经理
Caitlin：Rune Labs的下一步是什么？
Carolyn：我们希望帮助患者自己查看他们的数据，而不是需要去医院了解更多信息。我们知道不是每个人都对查看他们的状态感兴趣，但有些人非常感兴趣设备收集的数据以及他们所发生的事情。
目前，我们的平台非常针对帕金森病，但从软件工程的角度来看，有很多扩展的机会。就在今年，我们宣布了我们与海岸研究学院合作，帮助识别脊髓刺激器患者的多发性硬化症病变生物标志物（即脱髓鞘）。脱髓鞘是多发性硬化症的标准症状，当患者的免疫系统开始攻击神经纤维时，这会导致大脑和脊柱病变。
从InfluxDB的角度来看，我们希望利用InfluxDB的配置文件功能，因为我们想确保我们编写的查询是高效的。
